Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AU022751B1B0V2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AU022751B1B0V2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms