Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm2012B1B0R1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms