Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms