Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4A4UUI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms