Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttll11A4Q9F4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms