Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms