Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms