Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SetxA2AKX3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SetxA2AKX3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SetxA2AKX3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SetxA2AKX3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SetxA2AKX3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SetxA2AKX3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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