Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ambra1A2AH22 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms