Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms