Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms