Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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