Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RNP2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RNP2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RNP2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RNP2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0U1RNP2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms