Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrit3W8DXL4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms