Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm5538W4VSP6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5538W4VSP6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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