Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac5Q9Z2V6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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