Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms