Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubl3Q9Z2M6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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