Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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