Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cldn6Q9Z262 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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