Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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