Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccne2Q9Z238 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms