Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms