Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms