Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec2Q9WV35 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec2Q9WV35 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec2Q9WV35 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec2Q9WV35 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms