Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms