Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lemd3Q9WU40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms