Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms