Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp18Q9WTV6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp18Q9WTV6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms