Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv2Q9WTR1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms