Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slit2Q9R1B9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slit2Q9R1B9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms