Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trex2Q9R1A9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms