Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms