Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms