Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lamc3Q9R0B6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms