Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a4Q9QZR9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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