Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM8

Fbxo17, F-box only protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo17Q9QZM8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo17Q9QZM8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo17Q9QZM8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms