Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms