Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms