Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc1Q9QZF2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc1Q9QZF2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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