Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PnckQ9QYK9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms