Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip4Q9QXN3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms