Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Limd1Q9QXD8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limd1Q9QXD8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms