Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col5a3Q9JLI2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col5a3Q9JLI2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col5a3Q9JLI2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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