Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms