Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Nectin1Q9JKF6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Nectin1Q9JKF6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nectin1Q9JKF6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin1Q9JKF6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin1Q9JKF6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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