Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trem1Q9JKE2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem1Q9JKE2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms