Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms