Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms