Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc22Q9JIG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms